Trakya Bölgesindeki bal arılarında (apis mellifera l. ) mtDNA 16S rDNA ve ND5 genleri analizi
Loading...
Date
2017
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Access Rights
info:eu-repo/semantics/embargoedAccess
Abstract
Bu çalışmada, Türkiye’nin Trakya bölgesinde bulunan bal arısı populasyonları arasındaki genetik varyasyon 16S rDNA ve ND5 bölgeleri kullanılarak araştırılmıştır. PCR-RFLP ve DNA dizi analizi yöntemlerinden yararlanılarak mitokondriyel genomda DraI, MboII ve SwaI restriksiyon enzimleri kullanılarak değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Trakya bölgesini temsil edebilecek bal arısı populasyonlarından örneklenen Tekirdağ, Gökçeada, Çanakkale, Edirne ve Kırklareli’nin farklı yörelerinden olmak üzere toplam 100 adet işçi arı örneği materyal olarak kullanılmıştır. Bu çalışmada, 16S rDNA ve ND5 gen bölgelerinin DraI ve SwaI restriksiyon enzimleri ile kesiminde iki farklı haplotip belirlenmiştir. 16S rDNA/DraI kesimi bakımından Tip 1 haplotipinde 315, 212, 116, 116, 92, 70 ve 44 bç'lik yedi farklı bant gözlenmiştir. Tip 2 haplotipinde, C ? T transizyonu sonucu 705. pozisyonda meydana gelen nokta mutasyonu sonucu bu haplotip 8 bant görüntüsünü vermiştir (215, 212, 116, 116, 100, 92, 70 ve 44 bç). 16S rDNA/SwaI bakımından Tip 1 haplotipinde 359, 324 ve 282 bç’lik 3 farklı banttan oluşan kesim profili belirlenmiştir. 16S rDNA gen bölgesinin 196. nükleotidinde (A?T transversiyonu) meydana gelen nokta mutasyonu sonucu SwaI enziminin yeni bir kesim noktası oluşmuş ve 359, 324, 195 ve 87 bç’lik 4 bant profili elde edilmiştir. Fakat bu bölgenin MboII restriksiyon enzimi kesimi sonucunda tüm örneklerde 16S rDNA/MboII bakımından tek tip haplotip belirlenmiştir. ND5 bölgesinde ise DraI restriksiyon enzimi kesimi sonucunda varyasyon belirlenmiş ve iki haplotip elde edilmiştir. ND5/DraI bakımından Tip 1 haplotipinde 440, 270 ve 112 bç’lik 3 farklı banttan oluşan kesim profili tespit edilmiştir. ND5 gen bölgesinin 383. pozisyonda (T?C transizyonu) tek nükleotid değişimi sonucu DraI restriksiyon enziminin kesim noktası kaybolmuştur. Böylece jelde 112, 270 ve 440 bç’lik 3 bant sayısı 440 bç’lik bantın kaybolması sonucu 552 ve 270 bç’lik 2 bant modeli oluşan kesim profili elde edilmiştir. ND5 bölgesinin MboII ve SwaI restriksiyon enzimleri ile kesiminde varyasyon bulunmamış ve tüm örneklerde tek tip haplotip elde edilmiştir.
Description
Keywords
Apis mellifera l., mtDNA, 16S, rDNA, ND5, PCR-RFLP, DNA dizi analizi
