Türkiye’ de yetiştirilen mandaların mtDNA D-lood ve sitokrom b gen bölgeleri ile genetik çeşitliliğin belirlenmesi
Loading...
Date
2019
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Namık Kemal Üniversitesi
Access Rights
info:eu-repo/semantics/embargoedAccess
Abstract
Bu çalışmada, Türkiye’nin 6 bölgesinden toplanan 16 farklı manda populasyonunda mtDNA D-loop ve Cyto-b gen bölgesi çeşitlilikleri, populasyonlar arası farklılıklar ve bu populasyonların coğrafi dağılımları ile olan ilişkisinin ortaya konulması amaçlanmıştır. Bölgeler bazında en yüksek haplotip çeşitliği H=0.934 (±0.024) değeri ile İç Anadolu bölgesi populasyonlarında olduğu belirlenmişken, en düşük haplotip çeşitliliği ise 0.910 (±0.036) değeri ile Doğu/Güney Doğu Anadolu bölgesi populasyonlarında gözlenmiştir. Bölgelere göre nükleotit çeşitliliği sonuçları değerlendirildiğinde ise, en yüksek değerin Marmara/ Ege bölgesi populasyonlarında 0,00908 (±0.00073), en düşük değerin ise Karadeniz bölgesi populasyonlarında 0.00634 (±0.0073) olduğu gözlenmiştir. Tüm veriler birlikte değerlendirildiğinde, D-loop bölgesinin, Cyto b gen bölgesinden daha yüksek mutasyona sahip olduğu ve bu bölgenin Türkiye manda populasyonlarındaki genetik çeşitliliğin tanımlanmasında daha detaylı bilgi verebileceği belirlenmiştir. mtDNA üzerindeki iki ayrı bölge sonuçları incelediğinde, Türkiye’ de yetiştirilen mandaların iki ayrı farklı manda grubundan köken aldığı belirlenmiştir.
This study aimed to reveal the genetic diversity among the sub-population of Turkey’s water buffalo population (Bubalus bubalis) and relationship between the distiribution of polymorphic variants and geographical regions with respect to mtDNA D-loop and cyto-b gene regions. Experimental material of genetic characterization were consisted of 197 blood samples obtained from 16 provinces of 6 geographical regions of Turkey. According to the results of the mtDNA D loop gene region, the highest haplotype variance observed was H = 0.934 (± 0.024) in Central Anatolian populations, while the lowest haplotype diversity was 0.910 (± 0.036) in Eastern / South Eastern Anatolian populations. When the results of nucleotide diversity according to gene regions were evaluated, it was observed that the highest value was 0.00908 (± 0.00073) in the population of Marmara / Aegean region and 0.00634 (± 0.0073) in the Black Sea region populations. When all the result are evaluated together, the D-loop region showed more higher mutation of the gene regions comparing with cyto-b region and it’s concluded that d-loop gene region have more potential informatic content in Turkey’s water buffalo population. The maternal inheritance of water buffalo populations had shown that there were two distinct mitochondrial lineages in Turkey.
This study aimed to reveal the genetic diversity among the sub-population of Turkey’s water buffalo population (Bubalus bubalis) and relationship between the distiribution of polymorphic variants and geographical regions with respect to mtDNA D-loop and cyto-b gene regions. Experimental material of genetic characterization were consisted of 197 blood samples obtained from 16 provinces of 6 geographical regions of Turkey. According to the results of the mtDNA D loop gene region, the highest haplotype variance observed was H = 0.934 (± 0.024) in Central Anatolian populations, while the lowest haplotype diversity was 0.910 (± 0.036) in Eastern / South Eastern Anatolian populations. When the results of nucleotide diversity according to gene regions were evaluated, it was observed that the highest value was 0.00908 (± 0.00073) in the population of Marmara / Aegean region and 0.00634 (± 0.0073) in the Black Sea region populations. When all the result are evaluated together, the D-loop region showed more higher mutation of the gene regions comparing with cyto-b region and it’s concluded that d-loop gene region have more potential informatic content in Turkey’s water buffalo population. The maternal inheritance of water buffalo populations had shown that there were two distinct mitochondrial lineages in Turkey.
Description
Keywords
Bubalus bubalis, manda, mtDNA, D-loop, Sitokrom b, genetik çeşitlilik, Bubalus bubalis, water buffalo, mtDNA, D-loop, cytochrome b, genetic diversity
