Keçi türünde mikrosatellit polimorfizminin belirlenmesinde farklı çoklu-PZR (multipleks PCR) sistemleri

Abstract

Bu çalışma; TÜBİTAK tarafından TÜRKHAYGEN-I (Türkiye Yerli Evcil Hayvan Genetik Kaynaklarından Bazılarının In Vitro Korunması ve Ön Moleküler Tanımlanması-I) projesi kapsamında desteklenmiştir. Mikrosatellit belirteçler ile genetik çeşitliliğin araştırılması amacıyla keçi türünde 20 lokustan oluşan 4 farklı çoklu Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) sisteminin kullanılabilirliği ortaya konulmaya çalışılmıştır. Çalışmanın materyalini Türkiye’de yetiştirilen Ankara Keçisi, Kilis Keçisi, Honamlı Keçisi, Kıl Keçisi ve Norduz Keçisi gibi 5 farklı yerli keçi ırkı oluşturmuştur. Araştırmada 20 lokusa ilişkin tek tek PZR optimizasyonlarının yapılmasının yanı sıra; 4 farklı çoklu PZR sisteminin de optimizasyonları yapılmış; bu sistemlerin populasyon yapısı ve genetik çeşitliliğin araştırılmasında kullanılabilirliği vurgulanmıştır.

This study was supported by TUBITAK TURKHAYGEN-I (In Vitro Conservation and Preliminary Molecular Identification of Some Turkish Domestic Animal Genetic Resources-I) project. In order to investigate the genetic diversity of goat has been carried out with 20 different microsatellite markers in 4 different multi-locus polymerase chain reaction (PCR) system. Five different breed of domestic goat were used in the study namely Angora goat, Kilis goat, Honamlı goat, Hair goat and Norduz goat. PCR optimizations were made for individual locus and 4 different multiplex-PCR systems. The applicability of these systems were demonstrated for population structure and genetic diversity.