Multiple orthonairoviruses including Crimean-Congo hemorrhagic fever virus, Tamdy virus and the novel Meram virus in Anatolia
Göster/ Aç
Erişim
info:eu-repo/semantics/closedAccessTarih
2020Yazar
Ergünay, KorayDinçer, Ender
Kar, Sırrı
Emanet, Nergis
Yalçınkaya, Deniz
Dinçer, Pelin Fatos Polat
Linton, Yvonne-Marie
Üst veri
Tüm öğe kaydını gösterÖzet
We conducted orthonairovirus RNA screening of 7043 tick specimens-representing 16 species-collected from various regions of Anatolia. In 602 pools, Crimean-Congo hemorrhagic fever virus (CCHFV) Europe 1 and 2 lineages were detected in seven pools (1.1 %) comprising Hyalomma marginatum, Hyalomma scupense, Rhipicephalus bursa, Rhipicephalus sanguineus sensu lato and Rhipicephalus turanicus ticks. In pools of Hyalomma aegyptium, we detected Tamdy virus (TAMV) and an unclassified nairovirus sequence. Next-generation se-quencing revealed complete coding regions of three CCHFV Europe 2 (AP92-like) viruses, TAMV and the novel orthonairovirus, tentatively named herein as Meram virus. We further performed in silico functional analysis of all available CCHFV Europe 2, TAMV, Meram and related virus genomes. The CCHFV Europe 2 viruses possessed several conserved motifs, including those with OTU-like cysteine protease activity. Probable recombinations were identified in L genome segments of CCHFV and TAMV. Through phylogeny reconstruction using individual genome segments, Meram virus emerged as a distinct virus among species within the Orthonairovirus genus. It further exhibited conserved motifs associated with RNA binding, encapsidation, signal peptidase cleavage, post -translational modification, RNA-dependent RNA polymerase and OTU-like activities. Bole tick virus 3 was also detected in two pools with CCHFV reactivity. Hereby, we describe a novel tick-associated orthonairovirus, in a CCHFV-endemic region with confirmed TAMV activity. Human and animal health impact of these viruses need to be addressed.
Cilt
11Sayı
5Koleksiyonlar
İlgili Öğeler
Başlık, yazar, küratör ve konuya göre gösterilen ilgili öğeler.
-
Trakya bölgesi şeker pancarı üretim alanlarında beet necrotıc yellow veın vırus (bnyvv), beet western yellows vırus (bwyv) ve beet yellows vırus (byv) hastalıklarının saptanması üzerine araştırmalar
Özdemir, Harun (Namık Kemal Üniversitesi, 2014)Trakya Bölgesi’nin Edirne, Kırklareli ve Tekirdağ illerindeki şeker pancarı üretim alanlarında 2013 yılı üretim döneminde gerçekleştirilen sürvey çalışmalarında, verim kayıplarına neden olan virüs hastalıklarını saptamak ... -
Yalova ili kesme çiçek üretimi yapılan alanlarda Tomato spotted wilt virus (TSWV), Dasheen mosaic virus (DSMV) ve Cucumber mosaic virus (CMV)'lerinin saptanması üzerine araştırmalar
Kibar, Hacer (Namık Kemal Üniversitesi, 2014)Türkiye’de Yalova, süs bitkileri üretimi bakımından önemli illerden birisidir. Anthurium andreanum (Flamingo çiçeği), bazı orkide (Cymbidium spp.), gül (Rosa spp.) ve gerbera bitkileri başta olmak üzere çok değerli kesme ... -
TRAKYA BÖLGESİ ÇELTİK ÜRETİM ALANLARINDA ARPA SARI CÜCELİK VİRÜS HASTALIKLARI (BARLEY YELLOW DWARF VIRUSES- BYDVs)’NIN SAPTANMASI
AYDIN, Önder (Namık Kemal Üniversitesi, 2017)Barley yellow dwarf virus (BYDVs)’es tahıl üretim alanlarında verim ve kalite kayıplarına neden olan önemli tahıl virüs hastalıklarındandır. Tüm tahıl türlerinde zarara neden olan bu virüs hastalıklarının çeltik (Oryza ...