Yumurtalık Kanseri Hücre Soylarında CIP2A Onkogeni Mutasyonlarının Taranması

Abstract

Amaç: Kanserle ilişkili genetik değişimlerin belirlenmesi erken tanı, hastalığın takibi ve hedefe yöneliktedavi yaklaşımlarının geliştirilmesi açısından önem taşımaktadır. CIP2A, birçok insan kanserleri ileilişkilendirilmiş yeni tanımlanmış bir onkoproteindir. Birçok kanserde CIP2A gen ekspresyonununartışı gösterilmiştir ancak bu güne kadar AGS, HeLa, HT1080 kanser hücre soylarında CIP2A promotorbölge mutasyonlarının araştırıldığı ve tarafımızdan yapılmış olan bir çalışma dışında herhangibir kanser tipinde CIP2A geninin kodlayan dizilerindeki mutasyonlarını araştıran bir çalışma yapılmamıştır.Bu çalışmamızda CIP2A gen ekspresyonunun kanserdeki artışına ilişkin moleküler mekanizmalarınaydınlatılmasına katkıda bulunmak amacı ile bu genin onkogenik etkisinin oluşmasında rolüolması muhtemel regülatör bölge ve gen içi mutasyonlar araştırılmıştır.Gereç ve Yöntemler: CIP2A geninin kodlayan dizileri, ekzon-intron bağlantı bölgeleri ve promotorbölgesi DNA dizi analizi yöntemiyle SK-OV-3, Ov-CAR3 ve Caov-3 insan yumurtalık kanseri hücresoylarında taranmıştır.Bulgular: Ov-CAR3 hücre soyunda ekson 3, intron 6 ve intron 8’de, Caov-3 hücre soyunda ise sadeceintron 6 ve intron 8’de genomik değişimler saptanmıştır.Sonuç: Bulgularımız, yumurtalık kanseri için CIP2A ekspresyonundaki artışta CIP2A’daki genomikdeğişimlerin etkisini dışlamaktadır. CIP2A onkoproteinini yüksek düzeylerde ekspresyon eden hücrelerdebu duruma neden olabilecek diğer mekanizmaların da araştırıldığı fonksiyonel çalışmalaragereksinim vardır.

Objective: Determination of genetic changes associated with cancer is important for early diagnosis, follow-up of the disease and development of targeted therapeutic approaches. CIP2A is a newly identified oncoprotein associated with many human cancers. In many cancers, an increase in the CIP2A gene expression has been shown, but until now there has been no study investigating CIP2A promoter region mutations except our previous study about the mutations in the coding sequence of the CIP2A gene in AGS, HeLa, HT1080 cancer cell lines. The aim of this study was to contribute to the elucidation of the molecular mechanisms of CIP2A over expression in cancer and investigate the possible regulatory regions and intra-genic mutations that may play a role in the oncogenic effect of this gene. Material and Methods: The sequences encoding the CIP2A gene, exon-intron linkage regions, and the promoter region were screened in the SK-OV-3, Ov-CAR3, and Caov-3 human ovarian cancer cell lines by DNA sequence analysis. Results: Genomic changes were detected at exon 3, intron 6 and intron 8 in the Ov-CAR3 cell line and at intron 6 and intron 8 in the Caov-3 cell line. Conclusion: Our findings exclude the effect of genomic alterations in CIP2A in the increase in CIP2A expression for ovarian cancer. For cells expressing CIP2A oncoprotein at high levels, there is a need for functional studies to examine the underlying mechanisms.