Yazar "Topkaya, Aynur Eren" seçeneğine göre listele
Listeleniyor 1 - 20 / 20
Sayfa Başına Sonuç
Sıralama seçenekleri
Öğe Akut Gastroenteritli Çocuk Hastalarda Rotavirüs Antijen Pozitifliği ve Pozitifliğin Demografik Verilerle İlişkisi(2014) Alaşehir Akduman, Elçin; Balıkçı, Ahmet; Topkaya, Aynur ErenRotavirüs ağır gastroenteritlerin neden olduğu ölümlerin en sık nedenidir. Klinik, asemptomatik inf eksiyondan, ciddi diyareye kadar değişiklik gösterir. Bu çalışmada gastroenterit nedeniyle başvuran 0-16 yaş grubu çocuklarda rotavirüs antijen pozitif liği ve pozitif liğin demograf ik verilerle ilişkisi değerlendirilmiştir. Rotavirüs antijeni varlığı immünokromatograf ik yöntem kullanılarak araştırılmıştır. Toplam 1,168 hastaya ait dışkı örneğinin 211inde rotavirüs antijeni pozitif saptanmıştır. İlk iki yaşta (% 37.4) ve kış aylarında (% 28.90) rotavirüs sıklığı anlamlı derecede artmıştır. Özellikle kış aylarındaki iki yaş altı çocuk gastroenteritlerinde rotavirüs önemli bir etkendir ve rutin olarak araştırılmalıdırÖğe An unusual presentation of brucellosis: hepatic microabscesses(Wiley-Blackwell, 2017) Erdem, İlknur; Ali, Ritvan Kara; Elbasan, Senay; Özçağlayan, Ömer; Değirmenci, Pelin Osanmaz; Sedef, Samet; Topkaya, Aynur ErenHepatic abscess due to Brucella species is an extremely rare complication especially in acute illness. Here, we report a case of hepatic microabscesses probably caused by Brucella in a 33-year-old woman with acute infection who was successfully treated with a combination of doxycycline and rifampicin for 3 months.Öğe Antibacterial effects of curcumin: An in vitro minimum inhibitory concentration study(Sage Publications Inc, 2016) Güneş, Hayati; Gülen, Dumrul; Mutlu, Reyhan; Gümüş, Abdullah; Taş, Tekin; Topkaya, Aynur ErenAim: To evaluate the antibacterial effect of curcumin with the minimum inhibitory concentration (MIC) method in standard bacterial strains. Methods: The in vitro antibacterial activity of curcumin was evaluated against methicillin-sensitive Staphylococcus aureus (MSSA) (ATCC 29213), methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) (ATCC 43300), Enterococcus faecalis (ATCC 29212), Bacillus subtilis (ATCC 6633), Pseudomonas aeruginosa (ATCC 27853), Escherichia coli (ATCC 25922) and Klebsiella pneumoniae (ATCC 700603) using the macrodilution broth susceptibility test method. After incubation in tubes, the antibacterial activity of curcumin was detected by a lack of turbidity, which indicated the inhibition of bacterial growth. The concentration in the tube with the highest dilution showing no turbidity was defined as the MIC. Results: The curcumin MIC values were 175 mg/ml, 129 mg/ml, 219 mg/ml, 217 mg/ml, 163 mg/ml, 293 mg/ml and 216 mg/ml against P. aeruginosa, B. subtilis, MSSA, MRSA, E. coli, E. faecalis and K. Pneumonia, respectively. Conclusion: This study revealed antibacterial effects of curcumin against standard bacterial strains in high concentrations. Animal experiments have demonstrated that curcumin applied at high doses has strong antibacterial activity. There is a need for further in vivo studies to shed light on antibacterial effects of curcumin with high concentrations.Öğe Bakterilerde Epigenetik(Namık Kemal Üniversitesi, Tıp Fakültesi, 2013) Topkaya, Aynur Eren; Güneş, HayatiÖkaryotlarda olduğu gibi bakterilerde de epigenetik kontrolün önemli bir mekanizması DNA metilasyonudur. Bakterilerdeki metilasyonun ökaryotlardakinden farkı sitozin yerine yaygın olarak adeninin metillenmesidir. Bakterilerin birçok virülans faktörünün epigenetik mekanizmalarla kontrol edildiği düşünülmektedir. Bu konuda en çok çalışılan bakteriler Escherichia coli, Salmonella, Vibrio, Yersinia, Haemophilus, Brucella ve Pseudomonas cinsi olmuştur. Bakterilerde gen ifadelenmesinin nasıl kontrol edildiğinin bilinmesi infeksiyonların kontrolünde yeni seçeneklerin geliştirilmesi için umut olabilecektir. Yeni antibiyotik moleküllerinin geliştirilmesi gittikçe sınırlı bir hale gelmiştir. Moleküler mikrobiyoloji çalışmaları arttıkça, epigenetik mekanizmalar ile bakterilerin virülans faktörlerinin kontrol edilebileceği konusunda yoğunlaşılmıştır. Çok yakında cevaplanabileceğini umduğumuz iki soru Dam inhibitörlerinin infeksiyon tedavisi ve tümör baskılanması amacıyla kullanılıp kullanılmayacağıdır.Öğe Community-acquired Lower Urinary Tract Infections: Etiology, Antimicrobial Resistance, and Treatment Results in Female Patients(Wolters Kluwer Medknow Publications, 2018) Erdem, İlknur; Karaali, Rıdvan; Ardic, Enes; Omar, Şenay Elbasan; Mutlu, Reyhan; Topkaya, Aynur ErenBackground/Purpose: Most community-acquired urinary tract infections (UTIs) are usually treated empirically. The knowledge of antibiotic resistance patterns of the microorganisms causing UTI is essential for defining the empirical treatment. Objective: The aim of the present study is to determine the distribution of bacterial strains isolated from lower UTIs and their resistance patterns against commonly used antimicrobial agents and treatment results in female patients. Subjects and Methods: This is a retrospective analysis of medical case records of 90 female patients with lower UTI for a period of 4 years from January 2013 to December 2016 in a tertiary care hospital in the Trakya region of Turkey. Results: The most common causative agent was Escherichia coli (66.6% of cases) followed by Klebsiella pneumoniae (16.6%). Fosfomycin was the most active agent against E. coli (resistant isolates: 5.5%), followed by nitrofurantoin (resistant isolates: 7.4%). Extended-spectrum beta-lactamases (ESBLs) production was observed in 29 (32.2%) isolates (22 in E. coli, 6 in K. pneumoniae, and 1 in Enterobacter spp.). The antimicrobial resistance rates among ESBL-producing E. coli isolates for trimethoprim-sulfamethoxazole, ciprofloxacin, fosfomycin, and nitrofurantoin were 77.7%, 72.7%, 13.6%, and 18.2%, respectively (P < 0.05). The estimated microbiological eradication rates for nitrofurantoin and fosfomycin were 89.7% and 83.8%, respectively. Conclusions: The results of the present study indicate that nitrofurantoin and fosfomycin may be considered for empirical therapy of lower UTIs in Trakya region of Turkey.Öğe Epidemiology, Clinical and Microbiological Characteristics of Invasive Streptococcal Infections in Turkey, 2010-2011(Ankara Microbiology Soc, 2014) Topkaya, Aynur Eren; Balıkçı, Ahmet; Aydın, Faruk; Hasçelik, Ayşe Gülşen; Kayman, Tuba; Keşli, Recep; Bayraktar, BanuA one-year active surveillance study was conducted to investigate the epidemiological and microbiological characteristics of invasive group A streptococci (GAS) infections in Turkey and to provide data for the establishment of national preventive strategies related to invasive GAS infections. A total of 46 clinical microbiology laboratories from 12 different regions of Turkey (Istanbul; Eastern and Western Marmara; Eastern and Western Blacksea; Aegean; Mediterranean; Western, Central, Northeastern, Middle-eastern and Southeastern Anatolia) participated in the study. Accordingly, GAS strains isolated from sterile body sites (blood, cerebrospinal, synovial, pleural, peritoneal, pericardial fluids) in the study centers between June 2010-June 2011, were sent to Maltepe University Hospital Clinical Microbiology Laboratory for microbiological confirmation and further analysis. The isolates were identified by conventional methods, and for serotyping, opacity factor (OF) and T protein types were investigated. For genotyping GAS lysate preparation, emm gene amplification and sequencing were performed by using the protocols recommended by Centers for Disease Control and Prevention. A total of 65 invasive GAS strains were isolated in 15 of the participant centers, during the study period. The rate of invasive GAS isolation exhibited regional variation, with the highest rates in the Eastern Blacksea (Trabzon, n=19), followed by Istanbul (n=17) and Western Anatolia (Ankara, Konya, n=14). Of the patients with invasive GAS infection 33 were female, 32 were male, with the age range of 0-89 years. GAS strains were most commonly isolated from soft tissue specimens (n=18), followed by abscess material (n=10), sterile body fluids (n=8) and blood (n=7) samples. Serotyping revealed that 55% (36/65) of the strains were OF positive, and the majority of T protein was polygroup T (n=20), followed by U (n=14), B (n=5), X (n=3) and Y (n=2). T protein was not detected in 22 isolates. The strains were found to have 17 different emm types; emm1 (n=13), emm4 (n=6), emm6 (n=6), emm12 (n=6), emm24 (n=4), emm14 (n=3) and emm28 (n=3). Nine of the strains could not be typed by sequencing. The correlation between emm typing and serotyping was detected as 58%. It was observed that 26-valent vaccines included 70.5% of the invasive GAS strains included in this study. Our study provided initial data concerning the epidemiological properties of invasive GAS infections and characterization of GAS strains in Turkey. The incidence of invasive GAS infections is low in our country. Although immunization programme by 26-valent GAS vaccine is not currently an urgent public health issue for our country, the results of this study indicated that emm types 4 and 24 should better be included in such a vaccine to be used in Turkey. Additionally, since epidemiological features of GAS infections and the microbiological characteristics of the strains can vary by time, for the diagnosis of invasive streptococcal infections and to take the necessary preventive measures, epidemiological studies should be conducted repeatedly.Öğe Gemella morbillorum endocarditis in a patient with a bicuspid aortic valve(Kare Publ, 2021) Doğan, Mustafa; Topkaya, Aynur Eren; Alpsoy, Şeref; Gür, Özcan; Erdem, İlknurGemella morbillorum is one of the rare causative microorganisms of endocarditis. We herein report a case of infective endocarditis in a patient with bicuspid aortic valve caused by G. morbillorum. Infective endocarditis diagnosis was established based on the Modified Duke's criteria. The patient was successfully treated with medical-surgical management.Öğe Investigation of Synergistic Effects of Curcumin with Some Antibiotics in Extended Spectrum Beta Lactamase Positive Or Negative Escherichia Coli and Klebsiella Pneumoniae Isolates(Carbone Editore, 2013) Güneş, Hayati; Doğan, Mustafa; Gümüş, Abdullah; Mutlu, Reyhan; Topkaya, Aynur ErenIntroduction: In recent years resistance against some antibiotics, particularly carbapenems, one of the first options for treatment, has increased among extended spectrum beta lactamase (ESBL) producing E. coli and K. pneumoniae isolates. In this study. the influence of curcumin on amikacin, gentamycin, imipenem and ciprofloxacine minimum inhibitory concentration (MIC) values of ESBL positive and negative E. coli or K. pneumoniae isolates, was investigated. Methods: For this purpose, a total of 63 Escherichia coli (30 ESBL + and 33 ESBL -) and 22 K. pneumoniae isolates (10 ESBL + and 12 ESBL -) were included in the study. MIC values of bacteria were determined with microdilution method according to Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) recommendations. Synergistic effect of curcumin was studied with checkerboard method. Results: In both bacteria groups, ESBL + isolates were found to be more resistant against all tested antibiotics compared to ESBL - ones. Curcumin was detected not to have a synergistic effect with amikacin, gentamycin and ciprofloxacin in low and high concentrations. Curcumin/imipenem combination was determined to reduce MIC values of imipenem in all ESBL + and ESBL - E. coli and K. pneumoniae isolates resistant to imipenem and brought MIC values to susceptible limits. Conclusion: In conclusion, curcumin may be combined with carbapenems in severe infections caused by ESBL + E. coli and K. pneumoniae isolates, as its bioavailability is good and well tolerated in therapeutic concentrations.Öğe Kan Kültürü Şişesinden Doğrudan Yapılan Antibiyogram için Yöntemin Optimizasyonu(2015) Topkaya, Aynur Eren; Tombak, Özge[No Abstract Available]Öğe Kistik Fibrozlu Hastaların Solunum Yolu Örneklerinden Elde Edilen Pseudomonas aeruginosa İzolatlarının Çeşitli Virülans Faktörlerine Kurkuminin Etkisi(2018) Mutlu, Reyhan; Topkaya, Aynur ErenAmaç: Pseudomonas aeruginosa sahip olduğu virülans faktörleri ve antibiyotiklere direnç mekanizmaları ile kistik fibrozlu hastalarda tedavisi zor olan solunum yolu enfeksiyonlarına neden olmaktadır. Kurkuminin anti-inflamatuvar, anti-tümör gibi etkilerinin yanı sıra antibakteriyel etkiye de sahip olduğu bulunmuştur. Bu çalışmanın amacı, kistik fibrozlu hastaların solunum yolu örneklerinden elde edilen P. aeruginosa izolatlarının çeşitli virülans faktörlerine (biyofilm, elastaz, alkali proteaz) kurkuminin etkisinin araştırılmasıdır. Gereç ve Yöntem: Çalışmamızda, P. aeruginosa izolatlarının (n=65) kurkumin minimal inhibitör konsantrasyon (MİK) değerleri agar dilüsyon yöntemiyle çalışıldı. Virülans faktörlerinden biyofilm, elastaz ve alkali proteaz mikroplakta absorbans ölçümüne dayalı yarı kantitatif yöntemlerle araştırıldı. Virülans faktörü üretimi pozitif olan izolatlar aynı anda hem sub-MİK konsantrasyondaki kurkumine maruz bırakılarak hem de bırakılmadan virülans faktörü üretimini araştırmak için yeniden çalışıldı ve ölçülen absorbans değerleri istatiksel olarak karşılaştırıldı. Bulgular: Çalışmamızda, izolatların 11'inin (%16) kurkumin MİK değeri 250-500 ?g/ml arasında, 7'sinin (%11) kurkumin MİK değeri 501-1000 ?g/ml arasında, 5'inin (%8) kurkumin MİK değeri 1001-1500 ?g/ml arasında ve 42'sinin (%65) kurkumin MİK değeri 1500 ?g/ml üzerinde saptandı. İzolatların %54'ünde biyofilm üretimi, %74'ünde elastaz üretimi ve %68'inde alkali proteaz üretimi pozitif bulundu. Çalışılan bu üç virülans faktörünün üretimi açısından sub-MİK konsantrasyonlarda kurkumine maruz bırakılarak ölçülen absorbans değerleri ile kurkuminsiz olarak ölçülen absorbans değerleri arasında istatiksel olarak anlamlı bir fark saptanmadı.Sonuç: Çalışmamızın sonuçlarına göre, in-vitro ortamda bir kez kurkumine maruz bırakılan kistik fibroz izolatlarının virülans faktörlerinde istatistiksel olarak anlamlı bir azalma bulunmamıştır. Bununla birlikte, kurkuminin toksik olmayan, anti-inflamatuvar ve anti bakteriyel bir madde olması nedeniyle bu hasta gruplarında uzun süreli kullanımının in-vivo etkilerinin de araştırılması uygun olacaktırÖğe Kistik Fibrozlu Hastaların Solunum Yolu Örneklerinden Elde Edilen Pseudomonas aeruginosa İzolatlarının Çeşitli Virülans Faktörlerine Kurkuminin Etkisi(2017) Mutlu, Reyhan; Topkaya, Aynur ErenAmaç: Pseudomonas aeruginosa sahip olduğu virülans faktörleri ve antibiyotiklere direnç mekanizmaları ile kistik fibrozlu hastalarda tedavisi zor olan solunum yolu enfeksiyonlarına neden olmaktadır. Kurkuminin anti-inflamatuvar, anti-tümör gibi etkilerinin yanı sıra antibakteriyel etkiye de sahip olduğu bulunmuştur. Bu çalışmanın amacı, kistik fibrozlu hastaların solunum yolu örneklerinden elde edilen P. aeruginosa izolatlarının çeşitli virülans faktörlerine (biyofilm, elastaz, alkali proteaz) kurkuminin etkisinin araştırılmasıdır. Gereç ve Yöntem: Çalışmamızda, P. aeruginosa izolatlarının (n=65) kurkumin minimal inhibitör konsantrasyon (MİK) değerleri agar dilüsyon yöntemiyle çalışıldı. Virülans faktörlerinden biyofilm, elastaz ve alkali proteaz mikroplakta absorbans ölçümüne dayalı yarı kantitatif yöntemlerle araştırıldı. Virülans faktörü üretimi pozitif olan izolatlar aynı anda hem sub-MİK konsantrasyondaki kurkumine maruz bırakılarak hem de bırakılmadan virülans faktörü üretimini araştırmak için yeniden çalışıldı ve ölçülen absorbans değerleri istatiksel olarak karşılaştırıldı. Bulgular: Çalışmamızda, izolatların 11'inin (%16) kurkumin MİK değeri 250-500 ?g/ml arasında, 7'sinin (%11) kurkumin MİK değeri 501-1000 ?g/ml arasında, 5'inin (%8) kurkumin MİK değeri 1001-1500 ?g/ml arasında ve 42'sinin (%65) kurkumin MİK değeri 1500 ?g/ml üzerinde saptandı. İzolatların %54'ünde biyofilm üretimi, %74'ünde elastaz üretimi ve %68'inde alkali proteaz üretimi pozitif bulundu. Çalışılan bu üç virülans faktörünün üretimi açısından sub-MİK konsantrasyonlarda kurkumine maruz bırakılarak ölçülen absorbans değerleri ile kurkuminsiz olarak ölçülen absorbans değerleri arasında istatiksel olarak anlamlı bir fark saptanmadı.Sonuç: Çalışmamızın sonuçlarına göre, in-vitro ortamda bir kez kurkumine maruz bırakılan kistik fibroz izolatlarının virülans faktörlerinde istatistiksel olarak anlamlı bir azalma bulunmamıştır. Bununla birlikte, kurkuminin toksik olmayan, anti-inflamatuvar ve anti bakteriyel bir madde olması nedeniyle bu hasta gruplarında uzun süreli kullanımının in-vivo etkilerinin de araştırılması uygun olacaktırÖğe Kolistin Antimikrobiyal Duyarlılık Testinin Vıtek 2 ve Sıvı Mikrodilüsyon Yöntemleriyle Karşılaştırmalı Olarak Değerlendirilmesi(2020) Şafak, Birol; Tombak, Özge; Topkaya, Aynur ErenAmaç: Kolistin için hassas duyarlılık test yöntemlerine ihtiyaç vardır. Çalışmamızda VITEK 2 (bioMérieux, Marcy-L’Etoile, Fransa) otomatize sistem ile sıvı mikrodilüsyon yöntemini karşılaştırarak, VITEK 2 yönteminin kolistin duyarlılığını saptamadaki etkinliğini belirlemeyi amaçladık.Materyal ve Metot: Çeşitli Gram negatif bakterilerin kolistin duyarlılığı için laboratuvarımızda kullandığımız VITEK 2 otomatize sistem ve sıvı mikrodilüsyon yöntemini geriye dönük olarak karşılaştırıldı. Suşların tanımlanması konvansiyonel mikrobiyolojik yöntemler ve VITEK 2 otomatize bakteri tanımlama sistemi kullanılarak yapıldı. Bulgular: Çoğunluğu yoğun bakım ünitelerinden (n=56) izole edilen suşlar olmak üzere 104 Gram negatif mikroorganizmanın kolistin duyarlılık sonuçları karşılaştırıldı. Sıvı mikrodilüsyon yöntemi referans alındığında VITEK 2 ile 7 çok büyük hata (% 6.7), 4 büyük hata (% 3.8) tespit edildi. VITEK 2 için duyarlılık %92.9, özgüllük %20, pozitif prediktif değer %95.8, negatif prediktif değer % 12.5 olarak bulundu. Sonuç: Çalışmamızda VITEK 2, % 6.7’lik çok büyük hata oranı ve <% 90genel uyum oranıyla yöntem kabulu için gerekli kriterleri sağlayamadı. Kolistin duyarlılığını saptamada VITEK 2’nin kullanılabilirliği ile ilgili çok sayıda çalışmada farklı sonuçlar olsa da çalışmamızda yöntem kabulü için gerekli kriterleri sağlayamamıştır.Öğe Kurkumin, Timpanostomi Tüpleri Yüzeyinde Pseudomonas aeruginosa Biyofi lminin Oluşmasına Engel Olabilir mi?(2015) Çiftçi, Zafer; Deniz, Mahmut; Güneş, Hayati; Gümüş, Abdullah; Gültekin, Erdoğan; Topkaya, Aynur ErenTimpanostomi tüpü konulduktan sonra gelişen otorelerden, en çok tüp yüzeyinde oluşan bakteriyel biyofi lm sorumlu tutulmaktadır. Bu durumun önlenebilmesi için çok değişik yöntemler denenmiş ve bu yöntemlerin bazılarıyla da değişen oranlarda başarı elde edilebilmiştir. Ancak yöntemlerin hiçbiri biyofi lm oluşumunu tamamen önleyememiştir. Son zamanlarda yapılan bazı çalışmalarda, Curcuma longa (zerdeçal)'nın fenolik formu olan kurkuminin Pseudomonas aeruginosa'nın virülans faktörlerini etkilediğine dikkat çekilmiştir. Bu çalışmanın amacı, kurkuminin, in vitro ortamda, silikon timpanostomi tüplerinin yüzeyinde P.aeruginosa biyofi lminin oluşumuna engel olup olmadığının araştırılmasıdır. Bu amaçla, azalan konsantrasyonlarda kurkumin içeren kuyucuklar içerisinde 48 saatlik bir inkübasyonu takiben, timpanostomi tüpleri yüzeyinde oluşan P.aeruginosa biyofi lminin kalitatif ve kantitatif analizleri yapılmıştır. Kalitatif analiz için, tüpler çevresel taramalı elektron mikroskobu ile incelenerek biyofi lm varlığı açısından değerlendirilmiştir. Kantitatif analiz için, öncelikle tüp yüzeyinde tutunmuş olan bakteriler vorteksleme ve sonikasyon işlemleri kullanılarak tüp yüzeylerinden ayrıştırılmış; elde edilen bakteri solüsyonlarının seri (10'un katları olacak şekilde) dilüsyonları yapılmıştır. Seri dilüsyonlardan kalibre özeler kullanılarak koyun kanlı agarlara sayım plağı şeklinde ekim yapılmış ve 24 saatlik inkübasyon sonrasında kültürler değerlendirilerek sayım sonuçları koloni oluşturan birim (CFU)/mL olarak kaydedilmiştir. Çevresel taramalı elektron mikroskobu görüntüleri 100 ?g/mL'lik kurkumin konsantrasyonun biyofi lm oluşumunu önleyebildiğini ortaya koymuştur. Daha düşük konsantrasyonlarda, kurkuminin biyofi lm oluşumunu azalttığı, ancak tamamen önleyemediği görülmüştür. Kantitatif analiz sonuçları da, kuyucuklardaki kurkumin konsantrasyonu azaldıkça, CFU/mL değerlerinde anlamlı bir artış olduğunu göstermiştir. 100 ?g/mL ve 12.5 ?g/mL gruplarındaki CFU/mL değerleri sırasıyla, 35 ± 7.07 ve 650 ± 494 olarak tespit edilmiştir. Kurkuminin in vitro ortamda, minimum inhibitör konsantrasyon (MİK) değerlerinden daha düşük konsantrasyonlarda timpanostomi tüplerinin yüzeyinde P.aeruginosa biyofi lminin oluşumunu engellediği saptanmıştır. Çalışmamızın bulguları, kurkuminin lokal olarak uygulanmasının, timpanostomi tüpü konulması sonrası süpüratif otitis media gelişimine engel olabileceğini, tüpün lümeninin açık kalmasını sağlayabileceğini ve tedavi başarısızlık oranlarını azaltabileceğini düşündürmektedir. Sonuç olarak, kurkuminin in vitro koşullarda saptadığımız P.aeruginosa'nın biyofi lm oluşumunu önleyici etkisinin in vivo çalışmalarla da desteklenmesi gerektiği kanısına varılmıştırÖğe Namık Kemal Üniversitesi Sağlık Uygulama ve Araştırma Merkezi Kümülatif Antibiyotik Duyarlılık Raporu(2018) Kurç, Mine Aydın; Tombak, Özge; Gülen, Dumrul; Topkaya, Aynur ErenEnfeksiyon hastalıklarının tedavisi çoğunlukla empirik olarak düzenlenmektedir. Ulusal antimikrobiyal direnç profilinin takip edilmesi bu konuda yararlı olsa da, her kurumun kendi kümülatif antibiyotik duyarlılık raporlarını (KADR) hazırlaması klinisyenlere antibiyotik seçiminde önemli bir yol gösterici olacaktır. Bu çalışmada; Namık Kemal Üniversitesi Sağlık Uygulama ve Araştırma Merkezi Mikrobiyoloji Laboratuvarı'na gelen klinik örneklerden izole edilen Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter baumannii, Staphylococcus aureus, koagülaz negatif stafilokok (KNS) ve Enterococcus spp. suşları için KADR hazırlanması amaçlanmıştır. Laboratuvarımıza, 01.01.2014-31.12.2015 tarihleri arasında gelen idrar, yara, kan ve balgam örneklerinden izole edilen bakterilerin antimikrobiyal duyarlılık profili retrospektif olarak incelenmiştir. Antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi için Kirby-Bauer disk difüzyon yöntemi uygulanmış ve sonuçlar "Clinical and Laboratory Standards Institute" (CLSI 2013 M100-S23, CLSI 2014 M100-S24) önerilerine göre değerlendirilmiştir. KADR; "Analysis and Presentation of Cumulative Antimicrobial Susceptibility Test Data" (CLSI 2014, M39-A4) kriterleri doğrultusunda hazırlanmıştır. Çalışmaya 2014 yılında dahil edilen toplam 96 E.coli izolatına amikasin, ertapenem ve meropenemin etkisi % 100 iken; imipenemin % 98.9, nitrofurantoinin % 97.7 izolatta etkin olduğu bulunmuş; ampisilinin etkinliği ise % 16.48 gibi düşük bir oranda saptanmıştır. 2015 yılında ise; E.coli, K.pneumoniae, P.aeruginosa, A.baumannii, S.aureus, KNS, Enterococcus spp. izolatları değerlendirilmeye alınmıştır. Toplam 413 E.coli izolatında en yüksek duyarlılık % 95.8 oranında ertapenem için saptanırken, % 92.2 amikasin ve % 91.6 oranında nitrofurantoine duyarlılık tespit edilmiştir. K.pneumoniae (n:76) izolatları için en yüksek duyarlılık % 94.73 ile imipeneme, P.aeruginosa (n:72) izolatlarında % 76.3 ile gentamisine, A.baumannii izolatlarında (n:35) ise tigesikline % 85.7 oranında tespit edilmiştir. S.aureus izolatlarında (n: 64) metisilin duyarlılığı % 78.1 iken, vankomisin direnci saptanmamıştır. Enterococcus spp.(n:90) izolatlarında vankomisin duyarlılığı % 95.5 olup üç izolatta direnci belirlenmiş ve linezolid duyarlılığı % 92.2 olarak belirlenmiştir. KNS izolatlarında (n:89) en yüksek duyarlılık linezolid ve vankomisin antibiyotiklerine % 98.8 oranında tespit edilmiştir. Sonuç olarak, etken mikroorganizmaların ve direnç profillerinin dağılımı; hastanelerin hizmet sunduğu bölgenin demografik özellikleri, hasta grupları, antibiyotik kullanım politikaları gibi birçok faktörden etkilendiği için, bölgesel sürveyans verileri empirik antibiyotik tedavisini yönlendirmek için tam olarak yeterli değildir. Bu nedenle her hastanenin kendisine ait KADR'lerini hazırlaması uygun olacaktır. Bu konuda yaklaşık on beş yıldır uluslararası standartlar belirlenmiş ve rehberler yayımlanmış olmasına rağmen henüz KADR hazırlama yaygın olarak uygulanmamaktadır. Güncel rehberlere uygun yazılım sistemlerinin geliştirilerek bu raporların oluşturulması ve pratik bir şekilde verilere ulaşımın sağlanması gerekmektedir.Öğe Postoperatif Adenoviral Konjonktivit Epidemisi(2017) Yüksel, Turgut; Özdemir, Enis; Kuşkucu, Ahmet Mert; Topkaya, Aynur Eren; Erdem, İlknur; Horozoğlu, FatihGöz hastalıkları kliniklerinde hastaların muayenesinde kullanılan ortak cihazlar adenovirüs gibi etkenler için bulaş kaynağı olabilmektedir. Bu olgu sunumunda aynı gün katarakt veya pars plana vitrektomi cerrahisi geçiren, rutin 1. hafta kontrolleri yapılmış, postoperatif 10-18(Ortanca: 15. gün) günlerde, gözde kızarıklık, sulanma ve göz kapaklarında ödem şikayetleriyle kliniğimize müracaat eden 7 hastanın 7 gözüincelendi. Hastalardan ve poliklinikte ortak kullanılan cihazlardan ve ameliyathanede kullanılan topikal anestezik ve pupilla dilatasyonu içinkullanılan damlalardan bakteryel kültür ve viral moleküler testler için örnek alındı. Olguların göz örneklerinde ve tonometre ve pakimetre cihazlarında gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyon ile Adenovirüs tip 8 saptandı. Bakteryel kültürlerde üreme olmadı.Öğe Streptococcus pneumoniae sepsis as the initial presentation of systemic lupus erythematosus(Dove Medical Press Ltd, 2016) Erdem, İlknur; Omar, Şenay Elbasan; Karaali, Rıdvan; Güneş, Hayati; Topkaya, Aynur ErenObjective: Infections are among the most important causes of morbidity and mortality in patients with systemic lupus erythematosus (SLE) but are rare initial presentation of the disease. Therefore, in this study, we describe a case of Streptococcus pneumoniae sepsis in a young woman with previously undiagnosed SLE. Case report: A 23-year-old female patient was admitted to our outpatient clinic complaining of high fever (40 degrees C), chills, fatigue, generalized myalgia, and cough with brown sputum for 5 days. Blood cultures grew gram-positive coccus defined as S. pneumoniae using standard procedures. Antinuclear antibody was positive at a titer of 1/1,000, and anti-double-stranded DNA was positive at 984 IU/mL. She was diagnosed with SLE. Her respiratory symptoms and pleural effusion were considered to be due to pulmonary manifestation of SLE. Conclusion: The underlying immunosuppression caused by SLE could have predisposed the patient to invasive pneumococcal disease. It may also occur as a primary presenting feature, although a rare condition.Öğe Tekirdağ Bölgesi Dermatomikoz Hastalarının Klinik, Demografik ve Laboratuvar Sonuçları(2020) Albayrak, Hülya; Raimoğlu, Onur; Aydın Kurç, Mine; Yanık, Mehmet Emin; Topkaya, Aynur ErenAmaç: Dermatomikoz etkenleri coğrafik bölge, iklim, sosyoekonomik durum ve yaşam tarzı ile zamanla değişebilmektedir. Buçalışmada hastanemiz Dermatoloji kliniğine başvuran dermatomikoz ön tanısı olan hastaları retrospektif olarak değerlendirdik.Hastanemize başvuran hastalardaki demografik verilerin ve alınan örneklerden izole edilecek etkenlerin saptanması amaçlanmıştır.Materyal ve Metot: 2017 ile Aralık 2017 tarihleri arasında Namık Kemal Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi Dermatoloji Kliniğindendermatomikoz ön tanısıyla 448 hastadan elde edilen örnekler retrospektif olarak incelenmiştir.Bulgular: Çalışmamıza alınan hastaların hastaneye başvuruları en sık ayak tırnak değişikliklerine (%28,5) bağlı olurken bunu gövdelezyonları (%24,3) ve ayaktaki tırnak dışı (%22,5) deri lezyonları takip etmiştir. Laboratuvar yöntemiyle tanısı dışlanan hastalarda ise ensık ayırıcı tanıya giren lezyonlar; %44,4ile gövdede ve %22,2ile ayakta görülen (tırnak dışı) lezyonlardır. Mikroskopik direkt bakıda%35,8 vakada pozitiflik saptanmıştır. Yapılan mantar kültürlerinde tüm vakaların %5,8’inde üreme saptanmıştır. İzole edilen mantarların%56’sıTrichophyton rubrum, %12’si Candida albicans ve %8’i Microsporum canis olarak tespit edilmiştir.Sonuç: Ayak lezyonları en sık hastaneye başvuru sebebi olurken, Trichophyton rubrum en sık üreyen etken olarak saptanmıştır.Toplumda giderek artan immünsüpresif birey sayısının Candida albicans’ı ikinci üreyen etken olarak karşımıza çıkardığınıdüşünmekteyiz. Onikomikoz ve tinea pedisin hastaneye başvuruda sayıca fazla olması ayak hijyeni, bakımı ve korunmasının toplumsalbir sorun olduğunu düşündürmektedir.Öğe The gut microbiome in epilepsy(Academic Press, 2020) Şafak, Birol; Altunan, Bengü; Topçu, Birol; Topkaya, Aynur ErenThe close relationship between epilepsy and autoimmune diseases and the fact that the cause of epilepsy is idiopathic in 60% of cases suggest that intestinal microbiota may play a role in the etiology of epilepsy. In this study, we analyzed and compared the intestinal microbiota composition of patients with idiopathic focal epilepsy (n = 30) and healthy volunteer group (n = 10) by 16s ribosomal DNA sequencing. Proteobacteria phylum was found to be higher in patients with epilepsy (25.4%) than in healthy volunteers group (1.5%). The genera of Campylobacter, Delftia, Haemophilus, Lautropia, Neisseria among Proteobacteria phylum were found to be statistically significantly higher in patients with epilepsy than in healthy volunteers (p < 0.05). Fusobacteria phylum was detected in 10.6% of the patients with epilepsy but not in the healthy volunteer group. The genus of the Fusobacteria phylum was found as Leptotrichia and Fusobacterium. In our study, taxonomic drift and significant differences in the intestinal microbiota of patients with epilepsy according to healthy volunteer group showed that autoimmune mechanisms and inflammation may have a role in the etiology of epilepsy. Our data should be supported by other studies as to the role of the intestinal microbiome in the prevention and treatment of epilepsy. © 2019 Elsevier LtdÖğe The Relation of Methicillin-Resistance to Growth Time in Staphylococci(Carbone Editore, 2013) Topkaya, Aynur Eren; Güneş, Hayati; Gümüş, Abdullah; Taş, Tekin; Mengeloğlu, Fırat Zafer; Bayramoğlu, Gülçin; Aydın, Faruk; Topçu, BirolBackground: With the biochemical and molecular studies on penicillin-binding proteins associated with methicillin-resistance in staphylococci the determination and interpretation of the resistance have been changed. Particularly careful evaluation of staphylococci isolated from blood cultures before instituting therapy is of utmost significance in regard to morbidity and mortality. One of the important criteria of this evaluation is the growth tune of staphylococci. The purpose of this study was to determine the relation of methicillin-resistance to growth time in Staphylococcus aureus and methicillin-resistant staphylococci. Methods: The study was carried on a total of 66 clinical isolates of staphylococci including 18 methicillin-susceptible Staphylococcus aureus (MSSA), 14 methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA), 19 methicillin-susceptible coagulase-negatiye staphylococci (MSCNS) and 15 methicillin-resistant coagulase-negative staphylococci (MRCNS). Following growth on subculture under similar conditions, all isolates were inoculated in equal quantities into hemoculture bottles, the optimum time-of-positivity in minutes for each isolate was calculated, and the growth times of the 4 isolate groups were statistically compared. Results: The longest growth time was detected in MRCNS. The growth time was longer in MRSA and MRCNS than in MSSA and MSCNS, respectively; however, a statistically significant difference was observed between MRCNS and MSCNS isolates. Conclusion: In conclusion, it is known that in methicillin resistant Staphylococcus aerus, PBP2a which is responsible for methicillin resistance takes over the role penicillin-binding protein of PBP1. PBP2 and PBP3 in peptidoglycan synthesis. But, other possible factors affecting the resistance mechanisms or growth time of MRCNS should be investigated.Öğe Toplumsal Kaynaklı Üriner Sistem İnfeksiyonlarından İzole Edilen Escherıchıa Colı Suşlarında Fosfomisin, Nitrofurantoin ve Siprofloksasinin İn-Vitro Etkinliği(2014) Kurt, Ömer; Güneş, Hayati; Gümüş, Abdullah; Mutlu, Reyhan; Topkaya, Aynur ErenEscherichia coli, üriner sistem inf eksiyonlarından (ÜSİ) en sık izole edilen mikroorganizmadır. Son zamanlarda ülke- mizde üropatojen E.coli suşlarında, ÜSİ tedavisinde sık kullanılan antibiyotiklere karşı duyarlılıkta azalma görülmektedir. Bu çalışmada, ÜSİ ön tanısıyla üroloji polikliniğinden gönderilen idrar kültürlerinden izole edilen E.coli suşlarının siprof loksa- sin, nitrof urantoin ve f osf omisin duyarlılıkları, Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) önerileri doğrultusunda disk dif üzyon yöntemi ile belirlenmiş; genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (ESBL) üretimi çif t disk sinerji yöntemiyle araş- tırılmıştır. İncelenen E.coli izolatlarında en yüksek direnç oranı % 32.1 ile siprof loksasine karşı saptanmış, bunu % 5.1 ile nitrof urantoin ve % 4.5 ile f osf omisin takip etmiştir. ESBL pozitif lik oranı % 22.5 olarak tespit edilmiştir. Direnç oranları ESBL pozitif ve negatif lerde sırasıyla siprof loksasine karşı % 85.3 ve % 17.3 nitrof urantoine karşı % 12.6 ve % 2.9, f osf omi- sine karşı ise % 13.9 ve % 1.9 olarak saptanmıştır. Bölgemizde siprof loksasine direnç oranında yükselme gözlenmesine karşın f osf omisin ve nitrof urantoin, ÜSİ tedavisinde iyi birer alternatif olmayı sürdürmektedir.
