Yazar "Avci, Gamze" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 2 / 2
  • Küçük Resim
    Öğe
    Akut gastroenteritli hastaların klinik örneklerinde salmonella, shıgella ve campylobacter türlerinin kültür ve pcr yöntemi ile tespit edilmesi ve antibiyogram duyarlılığının saptanması
    (Tekirdağ Namık Kemal Üniversitesi, 2021) Avci, Gamze; Kiraz, Nuri
    Akut gastroenterit, özellikle gelişmekte olan ülkelerde önemli bir morbidite ve mortalite nedenidir. Beş yaş altı çocuklar daha sık etkilenmekle birlikte, tüm yaş gruplarında görülmekte ve ölüm nedeni olarak bazı ülkelerde kalp damar hastalıklarından sonra ikinci sırada yer almaktadır. Gastroenteritlerde etkenin belirlenmesi tedaviye yön vermesinin yanısıra, mortalite ve morbiditenin azalmasında önem taşımaktadır. Ayrıca bakteriyel enterokolitlerde etkenin belirlenmesi hastalığının yayılımın önlenmesi açısından da önemlidir. Su ve bazen gıda kaynaklı kitlesel salgınlar yapabilen bu bakteri türleri halk sağlığı için kayda değer öneme sahiptir. Salmonella spp., Shigella spp. ve Campylobacter spp. akut gastroenteritlerin bakteriyel etkenleri arasında genellikle ilk üç sırada yer alır. Sağlık bakanlığı laboratuvarlarının verilerine göre Shigella spp.'nin hemen hemen Campylobacter spp. ile benzer sıklıkta görüldüğü ve Salmonella spp.'den sonra ikinci sırada olduğu ve yılda 200 ila 400 arasında vaka bildirildiği bilinmektedir. Buna rağmen verilerin epidemiyolojik tahminlerin çok altında olduğu düşünülmektedir. Laboratuvarların tanımladıkları vakaları bildirmeyi ihmal etmeleri, inceleme yapan laboratuvar sayısının yeterli olmaması ve teknik yetersizlikler verilerin az olmasının nedenleri arasındadır. Buna ek olarak tanı kapasitesinin yetersizliği vakaların tanı alamamasına veya farklı tanılar almasına yol açmaktadır. Bölgemize ait Campylobacter, Salmonella ve Shigella epidemiyolojik verilerini ortaya çıkarmak için laboratuvarımıza gönderilen gaita kültürlerinden Campylobacter, Salmonella ve Shigella türlerinin üretilmesi ve PCR ile varlığının saptanması amaçlanmıştır. Araştırmamız için ishali olan hastalardan rutin poliklinik hizmeti kapsamında istenen gaita kültürü sonuçlarından yararlanılmıştır. Laboratuvarda rutin uygulamada gelen dışkı örnekleri; Campylobacter agar, Salmonella-Shigella agara ekim yapıldı. Moleküler çalışmalar için dışkı örneği -20 °C'de bekletildi. Salmonella ve Shigella türleri için 48 saat, Campylobacter türleri için 72 saat sonra kültürler değerlendirildi. Şüpheli üremelerden konvansiyonel yöntemler (TSI agar, antiserum, gram boyama, oksidaz vb.) ile tanımlama işlemi sonrası Salmonella, Shigella ve Campylobacter tespit edilen örnekler için EUCAST kriterlerine göre antibiyogram yapıldı. Campylobacter, Salmonella ve Shigella üreyen veya direkt mikroskobik incelemesinde lökosit görülen hastaların dışkı örneklerinden real-time PCR yöntemi ile Salmonella, Shigella ve Campylobacter varlığı araştırıldı. Ülkemizde ve dünyada gastroenterit şüpheli hastaların dışkılarında Campylobacter, Salmonella ve Shigella bulunma sıklığı (yaklaşık %5) baz alındığında 400 gastoenterit şüpheli hastanın dışkı örneğinin çalışılması yeterli bulunmuştur. Kültürde ve PCR'da elde edilen verilerin istatistiksel analizinin yüzde oranları: • Kültür sonuçları: Salmonella türü %1, Campylobacter türü %2,5 olarak tespit edildi. Shigella türü bakteri tespit edilmedi. • PCR sonuçları: Salmonella türü %1,25, Campylobacter türü %8,25 olarak tespit edildi. Shigella türü bakteri tespit edilmedi. Uygun programlar yürütülerek, gerçek epidemiyolojik veriler elde edilerek doğru ve güvenilir laboratuvar sonuçları sayesinde bu enfeksiyonların ciddi birer halk sağlığı sorunu olduğu anlaşılacak ve önem kazanacaktır.
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    Detection of Salmonella, Shigella and Campylobacter Species in Clinical Samples of Patients with Acute Gastroenteritis by Culture and Molecular Method
    (Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, 2022) Avci, Gamze; Kiraz, Nuri; Duran, Hülya; Erdal, Berna
    Acute gastroenteritis (AGE) is among the most common infectious diseases all over the world. Campylobacter, Salmonella and Shigella species are among the first bacterial agents of AGE. In this study, it was aimed to determine the prevelance of Campylobacter, Salmonella and Shigella by culture method and molecular method in stool samples sent to our laboratory and to compare both methods. Samples of adult and pediatric patients who applied to the Namık Kemal University Medical Faculty Hospital with the complaint of diarrhea between 2019-2020 were included. Stool samples were studied by conventional culture methods and polymerase chain reaction (PCR) method for the detection of Campylobacter, Salmonella and Shigella species. In our study, stool samples of 400 (77% adults, 23% children) patients were evaluated. In the evaluation of the samples by culture, agents were detected in 14 samples (3.5%), 10 (2.5%) were Campylobacter spp., 4 (1%) were Salmonella spp, Shigella spp. could not be isolated. By culture method, Campylobacter spp. and Salmonella spp. prevalence was 6.5% and 2.2% in children, and 1.3% and 0.7% in adults, respectively. In the evaluation of the samples by PCR, the causative agent was found in 38 samples (9.6%); Campylobacter spp. was found in 33 (8.3%) and Salmonella spp. was found in 5 (1.3%) samples, Shigella spp. not detected. The same causative microorganism was detected in the PCR method in all 14 stool samples with growth in the culture. In 24 samples, no growth was detected in the culture, only by PCR method, Campylobacter spp. or Salmonella spp. detected. Although stool culture is the gold standard method in the diagnosis of AGE, as a result of our research, PCR was found to be advantageous to culture because of its rapid results and high detection rate. Therefore, we believe that it would be beneficial to use molecular methods in routine diagnosis.