Yazar "Şimşek, Yaren İpek" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 2 / 2
  • Küçük Resim
    Öğe
    Flow sitometri ile ulusal elma genetik kaynaklarımızın çekirdek dna içerikleri ve ploidi düzeylerinin belirlenmesi
    (Tekirdağ Namık Kemal Üniversitesi, 2022) Şimşek, Yaren İpek; Tuna, Metin
    İnsanlık tarihinin ilk meyvesi olan elma (Malus × domestica ) yabancı döllenen bir türdür. Temel kromozom sayısı x=17 olan elma cinsi içerisinde ploidi, diploid (2n=2x=34) ile pentaploid(2n=5x=85) arasında değişim göstermektedir. Kültürü yapılan elma çeşitlerinin çoğunluğu diploid olmakla birlikte bir kısmı ise triploiddir. Bu yüksek lisans tez çalışmasının amacı flow sitometri ile Isparta Eğirdir Meyvecilik Araştırma Enstitüsü bünyesinde bulunan ulusal elma canlı genetik kaynak koleksiyonunu oluşturan genetik materyallerin çekirdek DNA içerikleri ve ploidi düzeylerini ilk defa belirlemektir. Koleksiyon yerli ve yabancı olmak üzere toplamda 340 farklı elma çeşit ve genotipini içermektedir. Çalışma da örnekler sağlıklı bitkilerin taze yaprakları kullanılarak hazırlanmıştır. Floresan boya olarak propidium iodide ve standart olarak Vicia sativa (Nilüfer yaygın fiğ ) kullanılmıştır. Elde edilen sonuçlara göre çalışma da kullanılan 340 adet elma çeşit ve genotipinin 2C çekirdek DNA içeriklerinin 1,46 pg ile 2,45 pg arasında değiştiği belirlenmiştir. Yapılan istatistiksel analizler sonucunda DNA içeriği farklılıklarının önemli olduğu saptanmıştır. Koleksiyonda yer alan elma çeşit ve genotipleri 2C çekirdek DNA içeriklerine göre diploid ve triploid olmak üzere çok kolayca ayırt edilebilen iki grup oluşturmaktadır. Ortalama 2C çekirdek DNA içeriği diploid ve triploidlerde sırasıyla 1,46 ile 1,69 pg ile 2,04 ile 2,45 pg arasında değiştiği belirlenmiştir. Yapılan bu çalışma sonunda ulusal elma genetik kaynak koleksiyonunda yer alan elma çeşit ve genotiplerinden 284 tanesinin diploid iken, 56 tanesinin ise triploid olduğu belirlenmiştir.
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    Nuclear DNA content and ploidy levels of living apple germplasm collection in Türkiye
    (2023) Kaçal, Emel; Şimşek, Yaren İpek; Seymen, Turgay; Özongun, Şerif; Tuna, Metin
    One of the key uses of flow cytometry is the estimation of nuclear DNA content and ploidy level, which has proven a reliable and effective approach in many studies. The primary goal of this research is to estimate the nuclear DNA content and ploidy level of the apple genetic resource collection maintained in the Fruit Research Institute’s living Malus collection for the first time using flow cytometry (for autochthonous varieties). Fresh apple leaf tissues were used for the flow cytometry analysis. For each genotype, nuclear DNA analysis was performed on three individual plants. Propidium iodide (PI) is used as a fluorochrome. Common vetch (3.65 pg/2C) was used as an internal standard. The 2C nuclear DNA content ranged from 1.46 pg to 2.45 pg. The variation in nuclear DNA content within the collection was statistically significant. Apple genotypes were split into two groups, diploid and triploid, according to their nuclear DNA content. Based on these results, 16.47% of apple genotypes were triploid, while 83.53% were diploid. The 2C nuclear DNA content in triploid genotypes varied from 2.04 to 2.45 pg and in diploids from 1.46 to 1.69 pg. The average nuclear DNA content in diploids was 1.56 pg, whereas it was 2.29 pg in triploids. The results of the study will be useful to determine the best strategies in breeding programs, as ploidy is one of the most important characteristics to consider in selecting parents for breeding purposes in addition to their agronomic characteristics.